In unmittelbarer Nachbarschaft zur Kirche St. Stephan prägt das Münster Unserer Lieben Frau das Lindauer Stadtbild. Es wurde zwischen 1748 und 1752 nach dem verheerenden Stadtbrand in Lindau durch den Baumeister Johann Caspar Bagnato errichtet, aus dessen Feder auch das Schloss und die Kirche auf der Insel Mainau und das Neue Schloss in Meersburg stammen. Im Jahr 1922 wurde das Gotteshaus erneut durch einen Großbrand zerstört – Dach und Decke des Kirchenschiffs stürzten ein. 2002 wurde die Stiftskirche dann schließlich durch den damaligen Bischof von Augsburg, Viktor Josef Dammertz zum Münster erhoben. Sehenswert sind insbesondere die Deckenmalereien, Fresken und Innenausstattung im Rokokostil.
